Климатические системы для лабораторных помещений должны обеспечивать необходимое качество воздуха и исключить передаваемое воздушными потоками загрязнение окружающей территории продуктами лабораторной деятельности. Для этого в лабораториях помещений НИИ устанавливается приточно-вытяжная система вентиляции с механическим побуждением.

Для зданий, расположенных в IV климатической зоне (жаркий климат) необходима для создания комфортных рабочих условий установка кондиционера. В зданиях, расположенных в других зонах, наличие кондиционера не является обязательным условием, а решается с учетом экономических обоснований.

В лабораториях должен быть предусмотрен необходимый минимум по очистке, осушению или увлажнению воздуха, а так же по его прогреву или охлаждению. Для производимых расчетов температуру, влажность и скорость воздушного потока следует принимать, как для промышленных помещений с легким видом работ, учитывая при этом технологический профиль лаборатории.

В помещениях, где происходят работы с выделением опасных, вредных или взрывоопасных веществ, нельзя применять вентиляционные системы с рециркуляцией воздуха. Вентиляция из таких помещений должна быть автономной от общей вентиляционной системы всего здания, но может объединять несколько лабораторий одного профиля. В лаборатории должны быть открывающиеся окна, а так же системы естественной вентиляции, для проветривания помещения во внерабочее время. При этом, в бактериологических лабораториях вентиляционные системы всех видов должны быть оборудованы системами очистки и обеззараживания воздуха.

Местные вытяжные установки бактериологических лабораторий должны быть в обязательном порядке оборудованы ультрафиолетовыми стерилизаторами воздуха, и быть строго изолированными от других вентиляционных систем. Если в помещении установлен кондиционер, то во время работы с патогенными биологическими агентами (ПБА) его необходимо выключать. В лабораториях, где могут быть химически активные летучие соединения, воздуховоды должны быть выполнены из коррозионно-стойких материалов.

Если лаборатория расположена в многоэтажном здании, воздуховоды должны быть выведены на крышу и превышать ее не меньше, чем на метр.